蛋白研セミナー・学術集会

蛋白研セミナー

ペタスケールの生体分子シミュレーション

場所 横浜市立大学鶴見キャンパス交流棟
日時 2010年1月26日(火)〜 27日(水)

大阪大学蛋白質研究所セミナー

 次世代生命体統合シミュレーション研究開発プロジェクト分子スケールワークショップ

 

ペタスケールの生体分子シミュレーション

 

【  場  所 】      横浜市立大学鶴見キャンパス交流棟

【 日  程 】      2010126日(火)〜 27日(水)

【オーガナイザ】      池口満徳(横浜市大),木寺詔紀(横浜市大・理研),

                   中村春木(阪大蛋白研)

 

事前登録不要・聴講無料

 

連絡先:池口 満徳 〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-29

          横浜市立大学 大学院生命ナノシステム科学研究科

          生体超分子システム科学専攻

          Tel:045-508-7232, Fax:045-508-7367

                     

【プログラム】

126日(火)

13:00-13:05            はじめに  中村春木(阪大蛋白研)

13:05-13:35            粗視化分子シミュレーション:CafeMolの現状と多剤排出

               トランスポーター研究

                               ○高田彰二(京大)

13:35-14:05            Evaluation of Electrostatic Interaction by New Summation Principle

                               in Molecular Dynamics

                               ○福田育夫,米澤康滋*,中村春木*(理研,*阪大蛋白研)

14:05-14:45            大規模並列時代の分子動力学コード

                               ○小山洋(理研CSRP

14:45-16:00            ポスターセッション

16:00-16:30            分子動力学計算を用いたF1-ATPase構造変化へのアプローチ

                               ○伊藤祐子,苙口友隆,池口満徳(横浜市大)

16:30-17:10            MD-SAXS法でみるタンパク質のゆらぎ

                               ○佐藤 衛(横浜市大)

17:10-17:50            蛋白質の体積物性と動力学の解析

                               ○曽田邦嗣,新保雄大,泰地真弘人(理研ASI

18:00-                    懇親会

 

127日(水)

10:00-10:30            シトクロムC3の全電子密度汎関数計算に関する研究

                               ○上村典子,平野敏行,佐藤文俊(東大生研)

10:30-11:00            密度汎関数理論に基づくQM/MM理論 線形応答解析による

        境界問題へのアプローチ

                               ○山中秀介,米澤康滋,中田一人*,高田俊和**

                  中村春木(阪大蛋白研,*NEC, **理研)

11:00-11:10            休憩

11:10-11:40            光合成細菌 Rh.sphaeroides 由来の反応中心内プロトン移動

               機構の解析

                               ○兼子祐,林重彦(京大理)

11:40-12:10            酵素触媒によるリン酸化反応の分子シミュレーション

                               ○李秀栄、Jaewoon Jung*、天能精一郎*、杉田有治

                 (理研, *神戸大)

12:10-12:15            おわりに 木寺詔紀(横浜市大・理研)

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