京阪奈計算生物物理学セミナー

京都、大阪、奈良周辺の計算生物物理学研究者が集まって情報を交換するセミナーで、年１回程度開催しています。

第５回

原研関西研究所 2012-03-30(金)(予定)

世話人：河野秀俊
石田 恒（原研）
「プロテアソームの基質認識メカニズム」
寺川 剛(京大・高田研)
「転写因子p53はDNA上をどのように走査するか？分子シミュレーションによる研究」
原野 雄一(阪大・蛋白研)
「蛋白質の水和問題：その理解の難しさに対する理論的アプローチ」
村上洋一 (医薬基盤研)
「機械学習法による配列情報のみを用いた蛋白質間相互作用の予測方法の研究開発」

第4回

医薬基盤研 2011-03-18 (金)

世話人：水口賢司
高田彰二（京大・高田研）
「構造インフォマティクスからの蛋白質の運動解析」
川端猛（奈良先・川端研）
「結合立体構造を正解とした化合物2D構造比較法の開発」
森田瑞樹（基盤研・水口研）
「タンパク質のリガンド結合部位と四次構造」

第3回

奈良先端科学技術大学院大学 2010-03-25

世話人：川端猛
金田 亮 Ryo Kanada (京都大 高田研)
Mechanism of unidirectional move of kinesin motor studied by molecular simulations
金城 玲 Akira Kinjo (大阪大 中村研)
Geometric similarities of protein-protein interfaces at atomic resolution are only observed within homologous families: An exhaustive structural classification study
松本 淳 Atsushi Matsumoto (原研・量子生命)
Global conformational changes of ribosome observed by normal mode fitting for 3D cryo-EM structures

第２回

大阪大学蛋白質研究所2008-06-20 (金)

世話人：金城玲
Lokesh P. Tripathi （医薬基盤研）
Genome wide survey of serine proteases
石田恒（原研）
分子動力学プログラムの応用と開発

第１回

京都大学理学部 2007-12-3 (月)

世話人：高田彰二
米澤康滋（大阪大学蛋白質研究所）
蛋白質のQM/MM連成シミュレーションプログラムの開発とその応用
郷信広（日本原子力研究開発機構）
Ｘ線自由電子レーザーによる単分子立体構造解析への展望