井上豪・松村浩由・安達宏昭・森勇介・高野和文・村上聡・福西快文・中村春木・木下誉富・仲西功・奥野恭史・南方聖司・三上義明・佐久間俊広・北島正人・福岡良忠・高田俊和・坂田恒昭「創薬バリューチェインのインシリコ技術を利用した阻害剤開発の試み」
日本結晶学会誌 (2010) Vol. 52, No. 1, 89-94.
米澤 康滋・山中 秀介・中村 春木，「蛋白質計算科学のさらなる発展を目指して：次世代スーパーコンピュータによるヘテロでダイナミックな蛋白質の電子構造解析」
生産と技術(2010), Vol. 62 , No. 1, 89-91.
神谷 成敏・肥後 順一・福西 快文・中村 春木「タンパク質計算科学」
(2009)共立出版（株）, 東京.
中村 春木，「７章タンパク質のデータベースとインフォマティクス」
やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法：タンパク質のはたらきを知る-分子機能と生体作用-（長谷・高尾・高木編）, pp. 135-165 (2009).（株）化学同人，京都．
中村 春木「第３章バイオテクノロジー分野, 3.3節「大規模生体分子QM/MD法」
計算力学シミュレーションハンドブック（日本計算工学会編）, pp. 148-154 (2009) 丸善（株），東京.
山崎秀樹、鷹野優、中村春木 「光合成反応中心スペシャルペアの電子非対称性の構造的起源 －量子化学計算とバイオインフォマティクスによるアプローチ」
生物物理（2009), Vol. 49, 84-85.
中村春木「蛋白質の構造から機能推定へ：構造バイオインフォマティクスによる解析」
蛋白質核酸酵素(2008), Vol. 53,
638-644.
中村春木，月原冨武「タンパク3000プロジェクトの産んだもの：特集にあたって」
蛋白質核酸酵素(2008) Vol. 53, 597-599.
中村春木 「蛋白質構造データバンクPDBとPDBjの誕生」
蛋白質核酸酵素 (2008), Vol. 53, 185.
中村春木「蛋白質構造情報の高度化と統合データベース」
蛋白質核酸酵素 (2007), Vol. 52, 1897-1905.
福西快文，中村春木「立体構造に基盤をおいた創薬研究，タンパク質構造と活性化化合物評価」
バイオテクノロジージャーナル (2007) Vol.7, No. 1-2, 122-125.
中村春木「技術としてのバイオインフォマティクスから科学としてのバイオインフォマティクスへ」
蛋白質核酸酵素(2006), Vol. 51, No. 12，1710-1711.
中村春木「バックボーンデータベースの標準化: PDBj」 特集「バイオデータベースの今」
情報処理学会会誌 (2006), Vol. 47, No. 3, 222-226.
大島泰郎、中村春木「オーバービュー：タンパク3000プロジェクトの伸展と世界の潮流」
蛋白質核酸酵素(2005) Vol. 50, No. 7, 831-835.
中村春木「蛋白質立体構造のデータベースと特許をめぐる動き」
蛋白質核酸酵素 (2004) Vol. 49,
No. 5, 673-676.
中村春木「分子薬物相互作用のシミューレーションとstructure-based
drug design」
医学のあゆみ (2003) Vol. 205,
463-465.
中村春木「タンパク質立体構造情報：ホモロジーモデリングと分子認識」
情報生物学講義2 タンパク質構造と情報科学(2003)松原謙一監修（財団法人国際高等研究所、京都、pp. 13-40 ）
木下賢吾、中村春木「タンパク質分子表面形状と物性のデータベース eF-site による分子機能類似性検索」
生物物理 (2002) Vol.42,
No.1, 20-23.
肥後順一、小野 聡、中島伸介、中村春木「多次元空間解析で迫る生体高分子の３次元立体構造とEnergetics」
統計数理 (2001) Vol.49, No.1, 57-75.
祐川和子、加藤善一郎、中村春木「遺伝子疾患の発症機構を蛋白質立体構造から探る」
蛋白質核酸酵素 (2001) Vol.46, No.12, 1813-1819.
松尾 洋、黒田 裕、木下賢吾、中村春木「構造ゲノム科学のためのバイオインフォマティクス」
実験医学 (2001)Vol.19, No.8, 934-940.
中村春木「構造バイオインフォーマティクス：生命科学と計算科学の融合」
生産技術誌 (2001) Vol. 53, No. 2, 27-29.
古川功治、中村春木「生体に学ぶ高親和性抗体の設計」
タンパク質の分子設計（後藤祐児、谷澤克行 編）（2001）第１章1-7 p. 122-134, 共立出版.
中村春木「構造生物学：特集によせて」
生物工学会誌 (2000) Vol. 78, No. 10, p. 419-419.
木下賢吾、中村春木「バイオインフォーマティクスによる相互作用解析２ 構造ゲノム学からのアプローチ」
実験医学別冊「プロテオーム解析法（磯辺俊明、高橋信弘編）」(2000) p.203-211.
中村春木「計算機科学による蛋白質のモデリングと自由エネルギー地形の解析」
生体分子解析研究センターだより (2000) No. 21, 17-28.
中村春木「構造生物学におけるコンピュータサイエンス」
化学と生物(1999)Vol.37, No.12, 826-832.
中村春木「構造ゲノム科学：構造生物学によるゲノム情報解析へのアプローチ」
蛋白質核酸酵素 (1999) Vol. 44, No. 4, 590-597.
古川功治、中村春木「タンパク質のネガティブデザイン」
生物物理 (1998) Vol. 38, No. 3, 94-98.
中村春木、「Bioinformatics による免疫機能分子構造モデリング」
日本臨牀 (1998) Vol. 56, No. 2, 795-802.
中村春木、有坂文雄「生命現象を規定するタンパク質のかたちと物性」
タンパク質のかたちと物性（中村春木、有坂文雄 編）（1997）序章 p. 1-20, 共立出版.
入佐正幸、中村春木「タンパク質立体構造の表示と立体構造データベースの利用」
細胞工学別冊「タンパク実験プロトコール２」第９章(1997) p.189-p216, 秀潤社 .
黒田 裕、中村春木「創造主の試行錯誤（タンパク質のデザイン）」
積み木細工の生物学（永田恭介、中西義信、白川昌宏 編）(1996) 第８章 p. 165-187, 共立出版.
中村春木「構造生物学が開く新しい世界」
科学 (1996) Vol. 66, No. 8, 532-539 岩波書店.
中村春木「生体分子の構造と物性の可視化」
精密工学会誌 (1996) Vol. 62, No. 5, 637-640.
小原雄治、中村春木、森山英明、中井謙太、五条堀孝「情報生物学の現状と将来」
蛋白質核酸酵素 (1995) Vol. 40, No. 12, 1784-1802.
中村春木、中井謙太「バイオテクノロジーのためのコンピュータ入門」
(1995) コロナ社.
中村春木、伏見譲「どこまで進むか？蛋白質の人工設計」
生物物理 別冊１ 第５章 p.103-132 (1994)
吉岡書店.
中村春木「蛋白質の設計」
蛋白質核酸酵素 (1994) Vol. 39, No. 7, 1373-1379.
高橋卓也、中村春木「分子認識における静電相互作用」
蛋白質核酸酵素 (1994) Vol. 39, No. 7, 1059-1065.
中村春木、金谷茂則「リボヌクレアーゼＨの構造機能相関」蛋白工学シリーズ
「ＨＩＶ治療薬の開発と蛋白工学（古市泰宏編）(1993) 講談社サイエンティフィク.
中村春木「新生化学実験講座１－タンパク質VIIタンパク質工学」
p.249-274、 (1993) 東京化学同人.
中村春木「コンピュータ解析－タンパク質のユニークな高次構造へのアプローチ」
細胞工学 (1993) Vol. 12, No. 1, 22-26.
中村春木「生体高分子解析とタンパク工学」
工業材料 (1992) Vol. 40, No. 6, 30-34.
中村春木「ＥＭＢＬでの人工蛋白質デザイン」
蛋白質核酸酵素 (1992) Vol. 37, No. 3, 679-682.
中村春木「蛋白質設計における静電相互作用の役割」
蛋白質核酸酵素 (1992) Vol. 37, No. 3, 611-619.
油谷克英、中村春木「蛋白質工学」
(1991) 朝倉書店.
中村春木・八尾 徹「コンピュータ支援による人工タンパク質設計」
化学と工業 (1991) Vol. 44, No. 5, 797-802.
中村春木「新生化学実験講座１－タンパク質Ⅲ高次構造」
p.246-254、(1990) 東京化学同人.
中村春木「蛋白工学研究法」池原編、
p.209-232、 (1989)
廣川書店.
中村春木「分子グラフィックスの世界」
化学と薬学の教室 (1989) No. 8, 1-4.
中村春木「蛋白質の静電場に関する諸問題」
生物物理 (1989) vol. 29. 339-345.
中村春木「分子グラフィックスの最新動向」
ＰＩＸＥＬ (1988) No. 74, 151-153.
中村春木「タンパク質工学実験マニュアル」池原・三木編
p.141-162、(1988) 講談社サイエンティフィク.
中村春木「タンパク質工学」三浦・大島・渡辺編
p.11-43、(1988) 啓学出版.
和田昭允、中村春木、陶山 明「ＣＧでバイオ分子をみる」
(1988) 東京化学同人.
中村春木「蛋白質構造予測とデザイン」
先端科学・技術開発年鑑 (1988) 315-326, 技術出版.
中村春木「タンパク質のデザインとその評価計算」
プロテインエンジニアリング (1988) 化学増刊113, 51-60.
中村春木「タンパク質デザインとその評価シミュレーション」
日本の科学と技術 (1987) vol. 28, No. 244, 74-78.
中村春木「タンパク質工学の現状と展望 ４ －コンピュター支援によるプロテインデザイン－」
バイオインダストリー (1986) vol. 3, 893-901.
中村春木「分子グラフィクスによる人工酵素の設計」
高分子 (1986) vol. 35,
946- 949.
中村春木「�U電緩和法」
蛋白質核酸化学 (1985) 別冊28, 211-213.
和田昭允、中村春木、陶山 明「コンピュータ分子生物物理」
数理科学 (1985) No. 268, 50-59.
中村春木「分子グラフィクスの生物物理への応用」
生物物理 (1985) vol. 25, 1-10.
中村春木「Molecular Graphics 学黎明期」
結晶解析研究センターだより (1984) No. 5, 10-15.
中村春木「時間領域における生体高分子の誘電緩和測定」
月刊フィジクス (1982) vol. 17, 465-470.
中村春木、伏見譲、和田昭允「疑似雑音法による誘電関数の測定」
固体物理 (1978) vol. 13, 407-415.