おうちでできる構造解析 SCALA
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動画の作り方 GUI編
動画の作り方 コマンド編
二次構造の割り当て(DSSP)
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点変異の導入
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> おうちでできる構造解析 > SCALA
SCALAの起動
"Import Integrated Data" サブメニューにある "Scale and Merge Intensities" をクリック
SCALAの実行
以下のように設定して、下の"Run" メニューから "Run Now" をクリック
"Ensure unique data & FreeR column" にチェックを入れる
"MTZ in"にiMosfilmで出力されたmtzファイルを入力する
結果の確認、分解能の決定
計算が終わると、FINISHEDとなります。
ダブルクリックすると、処理のログファイルを見ることが出来きます。統計値の確認ができます。
右クリック→View Log Graphsから統計値のグラフを見ることができます。
"Analysis against resolution" をクリックすると分解能とI/sigmaのグラフが表示されるので、 I/sigmaが2より大きい分解能を採用します。
分解能を変更して、もう一度SCALAを実行します。"MTZ out" は一回目の名前と被らないように変更します。
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