イネ萎縮ウイルス

イネ萎縮ウイルスの階層的構造形成

蛋白研内の関連した研究室

蛋白質結晶学研究室
蛋白質情報科学研究系
構造プロテオミクス研究系
プロテオーム物質創製研究系 月原グループ

日本のタンパク質結晶学の研究室

SPring-8
物質構造科学研究所（Photon Factory）
構造生物学坂部プロジェクト
北海道大学大学院理学研究科生体高分子解析学講座２（田中勲研究室）
北海道大学大学院薬学研究科構造生物学分野（稲垣冬彦研究室）
岩手医科大学薬学部（野中孝昌研究室）
高エネルギー加速器研究機構物質構造科学研究所構造生物学グループ（若槻壮市研究室）
東京大学大学院薬学研究科蛋白構造生物学教室（佐藤能雅研究室）
東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻食品工学研究室（田之倉優研究室）
東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻酵素学研究室（若木高善研究室）
東京大学大学院理学研究科生物科学専攻（横山茂之研究室）
東京大学大学院総合文化研究科（栗栖源嗣研究室）
東京大学分子細胞生物学研究所分子構造創生大部門生体超高分子分野（豊島近研究室）
お茶の水女子大学理学部化学科（今野美智子研究室）
理化学研究所横浜研究所ゲノム科学総合研究センタータンパク質構造・機能研究グループ（横山茂之チームリーダー）
昭和大学大学院薬学研究科薬品物理化学教室（中村和郎研究室）
東京工業大学大学院生命理工学研究科（竹中章郎研究室）
東京工業大学（濡木理研究室）
横浜市立大学生体超分子システム科学専攻生体超分子構造科学研究室（佐藤衛研究室）
横浜市立大学生体超分子システム科学専攻生体超分子設計科学研究室（Jeremy R. H. Tame研究室）
国立遺伝学研究所構造遺伝学研究センター超分子構造研究室（白木原康雄研究室）
名古屋大学大学院工学研究科生物機能工学専攻生体高分子機能化学講座（山根隆研究室）
名古屋大学大学院理学研究科物理学教室Ｊ研（神山勉研究室）
名古屋大学大学院理学研究科（前田雄一郎研究室）
京都大学大学院理学研究科化学専攻生物構造化学研究室（三木邦夫研究室）
京都大学大学院薬学研究科創薬科学専攻（加藤博章研究室）
京都大学化学研究所構造解析基礎研究部門１（畑安雄研究室）
奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻（箱嶋敏雄研究室）
蛋白質研究所蛋白質物理構造研究部門（月原冨武研究室）
蛋白質研究所蛋白質情報科学研究系（中村春木研究室）
大阪大学大学院工学研究科物質化学専攻（井上豪研究室）
大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻構造生物学研究室（福山恵一研究室）
大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻生体分子機能学研究室（倉光成紀研究室）
大阪大学大学院薬学研究科分子薬科学専攻高分子化学分野（大久保忠恭研究室）
大阪市立大学理学部化学科構造化学研究室（神谷信夫研究室）
兵庫県立大学大学院理学研究科生命科学専攻生体物質構造学 I 講座 （樋口芳樹研究室）
理化学研究所播磨研究所
構造生物物理学研究室（宮野雅司主任研究員）
城生体金属科学研究室（城宣嗣主任研究員）
研究技術開発室（山本雅貴室長）
メンブレンダイナミクスグループ（前田雄一郎、藤吉好則グループディレクター）
ストラクチュローム研究グループ（横山茂之、倉光成紀グループディレクター）
先端タンパク質結晶学グループ（横山茂之グループディレクター）
徳島文理大学健康科学研究所（津下英明研究室）
広島大学大学院数理分子生命理学専攻分子生物物理学講座（片柳克夫研究室）
九州大学生体防御医学研究所ワクチン開発構造生物学分野（神田大輔研究室）
九州大学生体防御医学研究所ポストゲノムタンパク質化学分野（稲葉謙次研究室）
熊本大学大学院薬学教育部分子機能薬学講座（山縣ゆり子研究室）

世界のタンパク質結晶学の研究室

MRC Lbaoratory of Molecular Biology, Cambridge

タンパク質結晶学のためのソフトウェア

Data Processing
Mosflm
Data Processing Suite (DPS)
HKL2000

Structure determination
CCP4 Program Suite
Global Phasing Limited (SHARP/BUSTER)
XtalView
SHELX
Solve
SnB
MAIN distribution

Model building
O
Alwyn Jones' page
Morten Kjeldgaard's page
XtalView
Turbo-Frodo

Refinement
X-PLOR Home Page
Ethan's X-PLOR scripts
ARP/wARP
SHELX
TNT

Molecular Graphics
MolScript
Raster3D
GRASP
SETOR
CMC Ribbons Software
Povscript
Molray
Connolly Surfaces
ORTEP-III
PLATON

Crystallographic tools
Uppsala Software Factory
bio.perl.org - Main page
XRayView

タンパク質結晶学の関連サイト

Protein Data Bank
PDBj
RCSB

SCOP: Structural Classification of Proteins
Cambridge

一次構造データベース
ExPASy
Swiss-BLAST Interface
Entrez

その他のデータベース等
EMBL: FSSP database
EMBL Dali: e3-D protein structure database searches
UCL BSM CATH classification
Uppsala ODICT Server
O Dictionary Library for Hetero Compounds
UCL Biochemistry Protein Analysis & Modelling
Ramachandran server
Crystal Twinning Server

シンクロトロン施設
Photon Factory, KEK
SPring-8
ESRF

関連学会
IUCr
IUCr homepage
The Crystallographic Society of Japan
Biophysical Society of Japan

Journals，出版社
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Nature Structural Biology
Science Online
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Cambridge University Press
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