2025年度採択課題一覧および研究成果報告書

共同研究員

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No	研究課題	共同研究員氏名	共同研究員所属	蛋白質研究所担当研究室
1	エピジェネティクスを介した遺伝子発現に与える栄養の効果	末武勲	神戸女子大学	蛋白質有機化学研究室
2	ほ乳類の生殖能力を制御する分泌蛋白質の生理機能解析	淨住大慈	立命館大学	蛋白質有機化学研究室
3	脂質化タンパク質LynのN末端ユニークドメインと内葉脂質の相互作用の解析	花島慎弥	鳥取大学	蛋白質有機化学研究室
4	蛍光γ・H2AXセンサーの開発	藤田英明	広島大学	蛋白質物理生物学研究室
5	クロロフィルのマグネシウム脱離酵素の構造解析	伊藤寿	北海道大学	蛋白質結晶学研究室
6	分子動力学シミュレーションによる、蛋白質とリガンドの分子間相互作用や結合自由エネルギーの算出に関する研究	神谷成敏	兵庫県立大学	蛋白質結晶学研究室
7	新規な銅タンパク質の構造研究	藤枝伸宇	大阪公立大学	蛋白質結晶学研究室
8	細胞内で集合体を形成する解糖系酵素エノラーゼ変異体の構造解析	三浦夏子	大阪公立大学	蛋白質結晶学研究室
9	ポスト構造生物学研究による創薬基盤技術の開発と蛋白質の機能制御	児島長次郎	横浜国立大学	蛋白質結晶学研究室
10	微生物が生産する糖質関連酵素の構造と機能解析	三宅英雄	三重大学	蛋白質結晶学研究室
11	糖質加水分解酵素ファミリー85 に属する酵素の基質認識機構	宮原郁子	大阪公立大学	蛋白質結晶学研究室
12	複合体タンパク質群の精密構造解析	大山拓次	山梨大学	蛋白質結晶学研究室
13	チラコイド膜リモデリングタンパク質の電子顕微鏡トモグラフィーによる構造解析	坂本亘	岡山大学	蛋白質結晶学研究室
14	クライオ電子顕微鏡解析で紐解くダイナミンおよびBARドメイン蛋白質の膜リモデリング機構とその破綻に起因する難治性疾患の発症機序	竹田哲也	岡山大学	電子線構造生物学研究室
15	細菌の細胞分裂タンパク質複合体の構造解析	松村　浩由	立命館大学	超分子構造解析学研究室
16	Pycocuccus furiosus およびGeobacillus kaustophilusを用いたウイルス様粒子への磁性ナノ粒子の合成と磁気緩和の検出	白土優	大阪大学	超分子構造解析学研究室
17	微生物由来ジペプチジルアミノペプチターゼの構造機能相関	阪本泰光	岩手医科大学	超分子構造解析学研究室
18	分子シミュレーションによる電位依存性膜タンパク質VSPの輸送機構研究	米澤康滋	近畿大学	超分子構造解析学研究室
19	ウイルス形成場バイロプラズマにおけるウイルス粒子形成機構解明を目指した構造生物学的研究	東浦彰史	広島大学	超分子構造解析学研究室
20	蛋白質アルギニンメチル基転移酵素１の基質相互作用様式の解明	藤間祥子	奈良先端科学技術大学	超分子構造解析学研究室
21	Trn１と新規カーゴの相互作用様式の解明	藤間祥子	奈良先端科学技術大学	超分子構造解析学研究室
22	DLHファミリータンパク質による基質認識機構解析	西野達哉	東京理科大学	超分子構造解析学研究室
23	タンパク質の活性化の原子スイッチング機構解明	海野昌喜	茨城大学	超分子構造解析学研究室
24	電位センサータンパク質群の動作機構の解明に向けた計算科学アプローチ	近藤寛子	北見工業大学	超分子構造解析学研究室
25	分子モータータンパク質のオリゴマー状態の決定	丹羽伸介	東北大学	超分子構造解析学研究室
26	リソソームエキソサイトーシスを制御するCa2+チャネルTRPML1複合体の構造解析	上西達也	大阪大学	超分子構造解析学研究室
27	バクテリオファージの立体構造解析	武田茂樹	群馬大学	超分子構造解析学研究室
28	In-situ光照射固体NMRによる光受容膜タンパク質の光反応過程に現れる光中間体の定常捕捉と構造解析	内藤晶	横浜国立大学	機能構造計測学研究室
29	アミロイド線維および液-液相分離形成過程における構造変化の追跡	宗正智	京都大学	機能構造計測学研究室
30	ヒト細胞内アミロイド凝集のDNPによる選択的高感度NMR解析	池中健介	大阪大学	機能構造計測学研究室
31	カゴ型ホスト錯体を用いた高分解能DNP固体NMR測定とカプセル型中空錯体の保護効果に基づく細胞内観測用耐還元型ラジカル偏極剤の調製	佐藤宗太	東京大学	機能構造計測学研究室
32	細胞内超分⼦構造体の構成タンパク質の固体NMR解析	竹中恒	東京大学	機能構造計測学研究室
33	アミロイド原性蛋白質を用いた蛋白質凝集機構の解明	山口圭一	大阪大学	機能構造計測学研究室
34	DNP-NMR法によるスピンラベルタンパク質の構造解析	荒田敏昭	大阪公立大学	機能構造計測学研究室
35	アルツハイマー型認知症を発症する遺伝子組換えマウスを用いた聴覚機能の測定と解析	日比野浩	大阪大学	分子発生学研究室
36	染色体構造依存的なdilncRNA代謝による修復経路選択機構の解明	東出望花	福井大学	ゲノム－染色体機能研究室
37	低分子量Gタンパク質を介した細胞内シグナルによる細胞骨格および細胞内輸送制御機構	宮本昌明	神戸大学	ゲノム－染色体機能研究室
38	Mre11エキソヌクレアーゼによるTopoII解離における分子機構の解明	篠原美紀	近畿大学	ゲノム－染色体機能研究室
39	DNA二本鎖切断修復における相同組換え制御機構の解明	高橋達郎	九州大学	ゲノム－染色体機能研究室
40	雌マウスの減数分裂前期の正確なステージングを実現する免疫染色法の開発	永松剛	山梨大学	ゲノム－染色体機能研究室
41	新しいコンディショナル変異体マウスモデルを用いたBRCA1、BRCA2遺伝子の機能解析	山田真太郎	東京都医学総合研究所	ゲノム－染色体機能研究室
42	生理活性ペプチドのストレス関連疾患における役割の解明	花田礼子	大分大学	高次脳機能学研究室
43	生物に普遍的に存在するtRNA wobble位ウリジン修飾に関する研究	中井由実	大阪医科薬科大学	オルガネラバイオロジー研究室
44	新規葉緑体光定位運動制御因子における相互作用因子の探索	比嘉毅	東京大学	オルガネラバイオロジー研究室
45	一細胞データによるシスエレメント活性情報同定手法の開発	粕川雄也	理化学研究所	細胞システム研究室
46	scRNA-seqデータを利用可能な遺伝子ネットワーク同定法の開発	木村周平	鳥取大学	細胞システム研究室
47	Machine Learning-Assisted Design for Cellular Toxicity Profiles of Amorphous Silica Nanoparticles	MARTIN	北海道大学	計算生物学研究室
48	ゲノムスケールでの蛋白質間相互作用予測及び統合データベースへの実装	村上洋一	東京情報大学	計算生物学研究室
49	金属イオン結合に伴い変化する蛋白質の動的構造解析	織田昌幸	京都府立大学	高磁場NMR分光学研究室
50	リポカリン型プロスタグランジンD2合成酵素の輸送機構の解明	上田卓見	大阪大学	高磁場NMR分光学研究室
51	アロステリック制御・残余構造に関わるタンパク質動的分子構造変化の理解	櫻井一正	近畿大学	高磁場NMR分光学研究室
52	シグナル伝達タンパク質の動的構造解析	杤尾豪人	京都大学	高磁場NMR分光学研究室
53	肉腫関連タンパク質のNMRによる構造情報取得	岩崎憲治	筑波大学	高磁場NMR分光学研究室
54	飢餓環境でがん幹細胞が生残優位性を発揮する分子機構の解明と鍵分子の同定	岸本幸治	徳島大学	生体分子解析研究室
55	酵素活性や複合体形成能を持つ蛋白質のDe Novo設計	小杉貴洋	分子科学研究所	蛋白質デザイン研究室
56	人工設計タンパク質の多量体化によるヘム結合サイトの設計手法の開発	近藤未奈子	浜松医科大学	蛋白質デザイン研究室
57	ヒト血管内のラミニンタイプの探索と再生3D血管への応用	豊原敬文	東北大学	マトリクソーム科学（ニッピ）寄附研究部門
58	味覚と内臓感覚の統合機構の解析	八十島安伸	大阪大学	高次脳機能学研究室

国際共同研究

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No	研究課題	国際共同研究員氏名	国際共同研究員所属	所在国	蛋白質研究所担当研究室
1	Development of on-resin synthetic methodologies for the preparation of cell-permeable cyclic peptides containing dithiolanes	Gloria Lourdes Serra Lemes	Universidad de la Republica	Uruguay	蛋白質有機化学研究室
2	Discovery of cyclic peptide-based antibiotics targeting bacterial lipid A or peptidoglycans, part I	Wei-Chieh Cheng	Academia Sinica	Taiwan	蛋白質有機化学研究室
3	Structural analysis of a plant glucosyl ceramidase(GBA2)-like enzyme from Arabidopsis thaliana	James Robert Ketudat Cairns	Suranaree University of Technology	Thailand	蛋白質結晶学研究室
4	Crystallization and X-ray analysis of a thermostable glycoside hydrolase family 43 β-xylosidase (GbtXyl43B) from Geobacillus thermoleovorans IT-08	Ni Nyoman Tri Puspaningsih	Universitas Airlangga, Indonesia	INDONESIA	蛋白質結晶学研究室
5	Structural and functional study on the survival-essential factors from bacterial pathogens for the development of novel antibiotics which induce suicide effect (phase IV)	Bong-Jin Lee	Ajou University	Republic of Korea	超分子構造解析学研究室
6	Structural analysis of Ca2+ -binding proteins from Schistosoma mansoni	Kwang Yeon Hwang	Korea University	Republic of Korea	超分子構造解析学研究室
7	Crystal structure determination enzymes for industrial, agricultural and medical applications	Mohd Shukuri Mohamed Ali	Universiti Putra Malaysia	Malaysia	超分子構造解析学研究室
8	Phase II Structural Investigation of Anticancer Target Proteins and Their Complexes with Therapeutic Inhibitors	Hyoun Sook Kim	National Cancer Center	Republic of Korea	超分子構造解析学研究室
9	Structural study of Cell penetrating peptides	Lee Soo Jae	Chungbuk National University	South Korea	超分子構造解析学研究室
10	Crystal structure of aminoimidazole ribonucleotide synthetase with co-factor and inhibitor complex	Chun-Jung Chen	National Synchorotron Radiation Research Center	Taiwan	超分子構造解析学研究室
11	Mathematical modelling of EML4-ALK-bound adaptor proteins in condensates	SAMPSON IOSIFINA	Imperial College London	UNITED KINGDOM	細胞システム研究室
12	In silico modelling of S. aureus’ impact on human keratinocyte NF-kB homeostasis and the skin’s innate immunity	Ahmad Abdullah Mannan	Imperial College London	United Kingdom	細胞システム研究室
13	Using single-cell genomics to investigate the progression of hepatocellular carcinoma	Haswanth Vundavilli	Indian Institute of Technology (Indian School of Mines), Dhanbad	India	計算生物学研究室
14	Computational Exploration of the Conformational Landscape Underlying the Function of the FABD-like Domain in HEV Polyprotein	Thibault Michel Joseph Tubiana	Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), CNRS/CEA	France	生体分子動態モデリング研究室
15	Elucidation of residue network working for allostery in Bacillus subtilis PyrR, using Molecular Dynamics, Thermodynamics and Machine Learning	Shubhra Ghosh Dastidar	Bose Institute	India	生体分子動態モデリング研究室
16	Deep learning for capturing signal-dependent enhancer heterogeneity at the single cell level	Ken Murakami	Research Institute of Molecular Pathology	Austria	細胞システム研究室
17	To study the role of 15N-dynamics on cognate DNA recognition of two transcription factors with diverse modes of DNA interaction.	Sulakshana Pradyot Mukherjee	Indian Institute of Science Education and Research (IISER) Berhampur	India	高磁場NMR分光学研究室

超高磁場ＮＭＲ共同利用研究課題

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	疾患関連蛋白質、機能性核酸、草木バイオマス抽出物の構造・機能・分子運動相関解析	永田崇	京都大学
2	高圧力NMR法による生体高分子の構造とダイナミクスの研究	北原亮	立命館大学
3	非標識NMRによるバイオ医薬品の評価法の開拓	谷中冴子	東京科学大学
4	細胞内環境におけるタンパク質の構造変化の原子レベル解析	森本大智	京都大学
5	タンパク質凝集の動的構造解析	菅瀬謙治	京都大学
6	二機能クリプトクロムの構造ダイナミクスに関する溶液NMR解析	久保稔	兵庫県立大学
7	高圧下における水素結合の挙動のNMR研究	武田光広	東京薬科大学
8	血清アミロイドAの線維形成における主要な構造変化	星野大	京都大学
9	藍色細菌生物時計発振機構の解析	武藤梨沙	東邦大学
10	NMRを用いた炎症シグナリングタンパク質とその制御化合物との相互作用の立体構造解析	寺沢宏明	熊本大学
11	トマトLE２５タンパク質の発現が乾燥ストレス耐性を誘導する分子機構	森田勇人	城西大学

クライオ電子顕微鏡共同利用研究課題

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	細菌において機能する標的タンパク質分解技術の開発	石川文洋	近畿大学
2	創薬、化学/光遺伝学ツール開発に資する膜タンパク質の構造解析	寿野良二	関西医科大学
3	クライオ電子顕微鏡を用いた創薬標的膜タンパク質の構造解析	浅田秀基	京都大学
4	膜内切断プロテアーゼリガンド複合体のクライオ電子顕微鏡解析	禾晃和	横浜市立大学
5	光遺伝子学ツール実装に向けた微生物ロドプシンの構造解析	錦野達郎	名古屋工業大学

MicroED共同利用研究課題

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	水の酸化を促進する錯体触媒の重要反応中間体の構造解析	八木政行	新潟大学
2	メカノケミカル法により合成した多成分系医薬品結晶における物理化学的特性変化の機能解明	佐々木俊之	高輝度光科学センター
3	ALS因子TDP-43のMicroED結晶構造解析	佐々木大輔	和歌山県立医科大学
4	含硫黄半導体MOFの結晶構造解析	田中大輔	関西学院大学
5	アミノ酸シッフ塩基金属錯体やリゾチーム複合体の微小結晶構造解析	秋津貴城	東京理科大学
6	３次元有機構造体の微小単結晶構造解析	瀬川泰知	自然科学研究機構
7	含フッ素アニオンを有する配位高分子の構造解析	野呂真一郎	北海道大学
8	多形化に基づき発生する微小な未知結晶形態の構造解析	林正太郎	高知工科大学
9	共平面的に芳香環が集積したナフタレンジケトン類縁体群の結晶構造解析：非古典的水素結合相互作用分子集積構造の相関解明	岡本昭子	東京農工大学
10	ペプチド系複雑天然物の構造解析	伊藤寛晃	東京大学
11	ポリN-イソプロピルアクリルアミドダイマー水溶液の温度誘起型相分離現象の解析	皆本千尋	東京工業高等専門学校
12	自己集積性ペプチドの構造解析	澤崎鷹	和歌山県立医科大学
13	π共役系炭化水素の極微小結晶の構造解析	西内智彦	大阪大学

客員フェロー

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No	実験課題	実験責任者	実験責任者所属
1	多剤排出トランスポーターの結晶構造解析およびクライオ電顕構造解析	村上聡	東京科学大学
2	ロドプシンのクライオ電顕単粒子解析	神取秀樹	名古屋工業大学

2025年度 採択課題一覧および成果報告書

採択課題一覧

成果報告書

共同研究員

国際共同研究

超高磁場ＮＭＲ共同利用研究課題

クライオ電子顕微鏡共同利用研究課題

MicroED共同利用研究課題

客員フェロー

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