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2016 OUTCOME REPORT

2016年度 採択課題一覧および成果報告書

成果報告書

OUTCOME REPORT

共同研究員

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No 研究課題 共同研究員氏名 共同研究員所属 蛋白質研究所担当研究室
1 セレン含有ペプチドの化学合成 岩岡 道夫 東海大学 理学部 蛋白質有機化学研究室
2 ライゲーション法によるアミロイド形成ペプチドの合成 田中 将史 神戸薬科大学 蛋白質有機化学研究室
3 C3a受容体アンタゴニストペプチドの開発 西浦 弘志 兵庫医科大学 蛋白質有機化学研究室
4 葉緑体光定位運動に関わる信号伝達系因子複合体の単離 和田 正三 首都大学東京 大学院理工学研究科 オルガネラバイオロジー研究グループ
5 原始紅藻シゾンを用いた葉緑体蛋白質輸送機構に関する研究 田中 寛 東京工業大学 資源化学研究所 オルガネラバイオロジー研究グループ
6 DNA脱メチル化の分子機構とその応用 白川 昌宏 京都大学 大学院工学研究科 エピジェネティクス研究グループ
7 プロフェノール酸化酵素の安定性とリフォールディング機構の検討 淺田 伸彦 岡山理科大学 理学部 蛋白質構造形成研究室
8 天然変成アミロイド蛋白質の多形構造形成に関するNMR解析 西村 千秋 帝京平成大学 薬学部 蛋白質構造形成研究室
9 溶液NMRをもちいたアミロイド線維の形成機構の解明 茶谷 絵里 神戸大学 大学院理学研究科 蛋白質構造形成研究室
10 アミロイド線維形成の分子機構に関する研究 八木 寿梓 鳥取大学 工学部附属グリーンサスティナブルケミストリー(GSC)研究センター 蛋白質構造形成研究室
11 アミロイド線維がミトコンドリア膜融合反応に与える影響 伴 匡人 久留米大学 分子生命科学研究所 蛋白質構造形成研究室
12 アミロイドーシス発症の分子機構の解明 内木 宏延 福井大学 医学部 蛋白質構造形成研究室
13 組み換え蛋白質を用いた難溶蛋白質凝集体可溶化の方法開発 櫻井 一正 近畿大学 先端技術総合研究所 蛋白質構造形成研究室
14 常磁性NMRを用いた生体高分子の構造解析 田中 好幸 徳島文理大学 薬学部 機能構造計測学研究室
15 転写活性化因子Sp1とTAF4の相互作用の分子機構 星野 大 京都大学 大学院薬学研究科 機能構造計測学研究室
16 固体NMR法とスペクトルシュミレーションの高度化による膜 タンパク質pHtrIIの立体構造解析 池田 恵介 富山大学 大学院医学薬学研究部 機能構造計測学研究室
17 膜タンパク質イオンチャネル構造の固体NMR解析 出村 誠 北海道大学 大学院先端生命科学研究院 機能構造計測学研究室
18 HicA toxinの生体内における阻害機構および構造の解明 山口 良弘 大阪市立大学 複合先端研究機構 機能構造計測学研究室
19 光照射固体NMRによる光受容膜タンパク質の光励起中間体生 成機構の解明 内藤 晶 横浜国立大学 大学院工学研究院 機能構造計測学研究室
20 新規阻害剤創製へ向けたチロシンキナーゼのNMRによる解析 小橋川 敬博 熊本大学 大学院生命科学研究部 機能構造計測学研究室
21 固体NMRと分子動力学法を組み合わせた立体構造解析 亀田 倫史 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 機能構造計測学研究室
22 DNA複製に関わるタンパク質群の精密構造解析 大山 拓次 山梨大学 大学院総合研究部 蛋白質結晶学研究室
23 Fold type I PLP酵素における酵素反応機構の解明 宮原 郁子 大阪市立大学 大学院理学研究科 蛋白質結晶学研究室
24 細胞内鉄代謝制御蛋白質Iron Regulatory Protein(IRP)の分子構造に基づく機能解析 石森 浩一郎 北海道大学 大学院理学研究院 蛋白質結晶学研究室
25 緑藻のフェレドキシン‐アイソフォームと光合成の電子伝達系に関与する蛋白質との相互作用の解析 池上 貴久 横浜市立大学 生命医科学研究科 蛋白質結晶学研究室
26 神経マイクロRNAの成熟脳活動における機能解析 疋田 貴俊 京都大学 大学院医学研究科 分子発生学研究室
27 網膜神経回路の電気生理学的解析 金田 誠 日本医科大学 分子発生学研究室
28 網膜電図による網膜視細胞たんぱく質の生体機能解析 上野 真治 名古屋大学 医学部附属病院 分子発生学研究室
29 減数分裂期の染色体動態制御機構の解明 山本 歩 静岡大学 理学部 ゲノム-染色体機能研究室
30 低分子量Gタンパク質を介した細胞内シグナルの、細胞骨格 および膜輸送制御における役割 宮本 昌明 神戸大学 研究基盤センター ゲノム-染色体機能研究室
31 マウス受精卵における相同組み換えによる遺伝子修飾法の 確立 広常 真治 大阪市立大学 医学部 ゲノム-染色体機能研究室
32 大豆成分による脂質代謝改善効果の分子機構 井上 裕康 奈良女子大学 研究院生活環境科学系 機能・発現プロテオミクス研究室
33 酸化ストレスによる赤血球蛋白質の酸化的修飾の解明 藤井 順逸 山形大学 大学院医学系研究科 機能・発現プロテオミクス研究室
34 がん転移において遠隔臓器特異的に発現するタンパク質の解析 富田 毅 東京女子医科大学 医学部 機能・発現プロテオミクス研究室
35 脳内の新規行動制御因子の構造解析ならびに同定方法の探索 深田 吉孝 東京大学 大学院理学系研究科 機能・発現プロテオミクス研究室
36 細胞内小胞輸送を制御するタンパク質翻訳後修飾の解析 西河 淳 東京農工大学 大学院農学研究院 機能・発現プロテオミクス研究室
37 セルロース合成酵素複合体の会合体構造解析 今井 友也 京都大学 生存圏研究所 分子創製学研究室
38 動物細胞発現系を用いた1回膜貫通型受容体の発現と構造機能解析 禾 晃和 横浜市立大学 大学院生命医科学研究科 分子創製学研究室
39 カテコール-O-メチル転移酵素活性調節部位の解明 飯島 洋 日本大学 薬学部 超分子構造解析学研究室
40 A群レンサ球菌における菌体表層タンパクの構造基盤解析 山口 雅也 大阪大学 大学院歯学研究科 超分子構造解析学研究室
41 トビイロウンカ由来グルタチオン転移酵素基質認識部位の構造解析 山本 幸治 九州大学 大学院農学研究院 超分子構造解析学研究室
42 バクテリオファージの立体構造解析 武田 茂樹 群馬大学 大学院理工学府 超分子構造解析学研究室
43 光科学系Ⅱ蛋白質複合体および光合成関連蛋白質の高圧凍結法による結晶性の改良 梅名 泰史 岡山大学 大学院自然科学研究科 超分子構造解析学研究室
44 室温条件下での食品タンパク質の佐用機作に係る高分解構造解析 桝田 哲哉 京都大学 大学院農学研究院 超分子構造解析学研究室
45 キノコ由来リボヌクレアーゼのヒト腫瘍細胞増殖抑制作用の解明と応用 小林 弘子 日本大学 薬学部 超分子構造解析学研究室
46 病原菌由来ジペプチジルアミノペプチダーゼの構造解析 阪本 泰光 岩手医科大学 薬学部 超分子構造解析学研究室
47 細胞分裂必須タンパク質の構造機能相関の解明と阻害剤開発 松村 浩由 立命館大学 生命科学部 超分子構造解析学研究室
48 C型肝炎ウイルスコア蛋白質のX線結晶構造解析 森田 英嗣 弘前大学 農学生命科学部 超分子構造解析学研究室
49 成長因子シグナル分子mTORC1の活性制御複合体Regulatorの構造解析 岡田 雅人 大阪大学 微生物病研究所 超分子構造解析学研究室
50 Pycocuccus furiosus virus-like Particle(PFV)を用いた磁性ナノ粒子の3次元規則配列とナノ磁性素子への応用 白土 優 大阪大学 大学院工学研究科 超分子構造解析学研究室
51 中性子結晶構造解析に基づく銅/TPQ含有アミン酸化酵素の コンフォメーション制御機構の解析 村川 武志 大阪医科大学 超分子構造解析学研究室
52 DNA修復因子FANC-M/CENP-SX複合体の立体構造解析 西野 達哉 東京理科大学 基礎工学部 超分子構造解析学研究室
53 細胞膜におけるリン脂質の非対称分布とその崩壊 長田 重一 大阪大学 免疫学フロンティア研究センター 超分子構造解析学研究室
54 抗原‐抗体間のフレキシブルドッキング分子動力学シミュレーションに関する研究 神谷 成敏 理化学研究所 計算科学研究機構 蛋白質情報科学研究室
55 転写因子および酵素の構造機能解析にむけた分子間相互作用解析 織田 昌幸 京都府立大学 大学院生命環境科学研究科 蛋白質情報科学研究室
56 金属蛋白質の電子構造制御に関する理論的研究 鷹野 優 広島市立大学 大学院情報科学研究科 蛋白質情報科学研究室
57 タンパク質立体構造上のイントロン位置が形成する平面とそこに含まれるリガンドに関する動的構造の解析 野坂 通子 佐世保工業高等専門学校 蛋白質情報科学研究室
58 タンパク質中のD-アミノ酸残基の起源および役割についてのin silico解析 小田 彰史 名城大学 薬学部 蛋白質情報科学研究室
59 リアルタイムNMR法によるDnmt3aのDNAメチル化反応の解析 古川 亜矢子 横浜市立大学 大学院生命医科学研究科 エピジェネティクス研究グループ
60 血小板凝集因子ポドプラニンの立体構造解析 加藤 幸成 東北大学 大学院医学系研究科 分子創製学研究室
61 電顕負染色単粒子解析法による細胞内膜裏打ち分子アファディンの構造の解明 高井 義美 神戸大学 大学院医学研究科 分子創製学研究室
62 NMRによる細菌性膜貫通型シグナル伝達蛋白質pHtrIIのナノディスク上での構造解析 小澤 潔 大阪大学 大学院基礎工学研究科 機能構造計測学研究室
63 新規な銅タンパク質の構造研究 藤枝 伸宇 大阪大学 大学院工学研究科 蛋白質結晶学研究室
64 ケンブリッジ結晶学データベースを用いた、生理活性物質、特にC-末端アミド化ペプチドの構造と機能に関する研究 尹 康子 大阪薬科大学 蛋白質情報科学研究室
65 ケンブリッジ結晶学データベースを用いたペプチドヘリックスのデザインとらせん性に関する研究 土井 光暢 大阪薬科大学 蛋白質情報科学研究室
66 分子動力学計算プログラムmyPresto/Omegageneの開発と応用 笠原 浩太 立命館大学 生命科学部 蛋白質情報科学研究室
67 ケンブリッジ結晶学データベースを用いた機能性有機分子化合物に関する研究 飯田 拡基 島根大学 大学院総合理工学研究科 蛋白質情報科学研究室
68 シアノバクテリアの光受容体群シアノバクテリオクロムの立体構造の解明 成川 礼 静岡大学 理学部 蛋白質結晶学研究室
69 染色体上のDNAメチル化領域を決定する機構解明Ⅳ 多田 政子 鳥取大学 染色体工学研究センター エピジェネティクス研究グループ
70 DNAメチル化認識タンパク質MBD1を用いたDNAメチル化部位の核内分布解析 檜枝 美紀 愛媛県立医療技術大学 臨床検査学科 エピジェネティクス研究グループ
71 歯周病細菌ポルフィロモナス・ジンジバリスの表層タンパク質HBP35の分子内ドメインの機能・構造解析 中山 浩次 長崎大学 大学院医歯薬学総合研究科 超分子構造解析学研究室
72 フラビン酵素の基質認識・反応メカニズムに関する研究 玉置 春彦 熊本大学 大学院生命科学研究部 蛋白質有機化学研究室
73 筋委縮関連因子群の構造生物学 真板 綾子 徳島大学 大学院医歯薬学研究部 機能構造計測学研究室
74 ケンブリッジ結晶学データベースの利用による、自然分晶可能なヘテロ環化合物の探索・設計に関する研究 国本 浩喜 金沢大学 国際基幹教育院 蛋白質情報科学研究室
75 ケンブリッジ結晶学データベースを用いた金属媒体による水の酸化触媒の設計・開発に関する研究 八木 政行 新潟大学 自然科学系 蛋白質情報科学研究室
76 SAIL蛋白質調製と固体NMRへの応用 甲斐荘 正恒 首都大学東京 理工学研究科 機能構造計測学研究室

国際共同研究

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No 研究課題 国際共同研究員氏名 国際共同研究員所属 所在国 蛋白質研究所担当研究室
1 Novel Strategy for Generation of Peptide Thioester via N-S Acyl Transfer for Synthesis of Glycoproteins SHARMA ROHIT KUMAR Panjab University India 蛋白質有機化学研究室
2 Real-time monitoring of k-casein fibril formation by total internal reflection fluorescence microscopy CARVER JOHN ADRIAN The Australian National University Australia 蛋白質構造形成研究室
3 Role of transient (fuzzy) interactions and dynamics in the interaction of an intrinsically disordered malaria vaccine candidate with the immune system NORTON RAYMOND STANLEY Monash University(Parkville Campus) Australia 機能構造計測学研究室
4 Structural investigation of β-glucosidase mechanism and complexes with substrates. CAIRNS JAMES ROBERT Suranaree University of Technology Thailand 蛋白質結晶学研究室
5 Software tools and method for interpreting mass spectrometry experiments and Proteomics date FERNANDEZ DE COSSIO Center for Genetic Engineering and Biotechnology Cuba 機能・発現プロテオミクス研究室
6 Structural studies on viruses with a beam of an X-ray and an electron HAJDU JANOS Uppsala University Sweden 超分子構造解析学研究室
7 Development of a pipeline for the refinement of proteinligand complexes KANAGARAJ SEKAR Indian Institute of Science, Bangalore, INDIA India 超分子構造解析学研究室
8 Structure of RavZ from Legionella pneumophilia SONG HYUN KYU Korea University Korea 超分子構造解析学研究室
9 Structure characterizations of shrimp nodaviruses viruslike particles CHEN CHUN-JUNG National Synchorotron Radiation Research Center Taiwan 超分子構造解析学研究室
10 Crystallization of Microprocessor component LEE SOO JAE Chungbuk National University Korea 超分子構造解析学研究室
11 Identification of the molecular framework for the design of Hemagglutinin based universal influenza vaccine using virtual system coupled adaptive umbrella sampling LE LY International University,National University of Ho Chi Minh City, Vietnam Vietnam 蛋白質情報科学研究室
12 Structural and functional research on the survivalessential factors from bacterial pathogens for the development of novel antibiotics which induces suicide effect. LEE BONG-JIN Seoul National University Korea 超分子構造解析学研究室
13 Development and applications of solid-state NMR techniques to study the structure and dynamics of biosolids RAMAMOORTHY AYYALUSAMY University of Michigan USA 機能構造計測学研究室
14 NMR analysis of α-synuclein and CNT interaction PAIK SEUNG R. Seoul National University Korea 機能構造計測学研究室
15 Strucutral characterization of VP37 protein from wthitespot syndrome virus(wssv) KHUNRAE PONGSAK King Mongkut’s University of Technology Thonburi Thailand 超分子構造解析学研究室
16 Structures and functions of Dnmtl mutants identified by genetic screen IWANAMI NORIMASA Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics Germany エピジェネティクス研究グループ
17 Structural Studies of Membrane Viral Channels Using NMR TORRES JAUME Nanyang Technological University(Singapore) Singapore 機能構造計測学研究室
18 Structural analysis of human Leucyl-tRNA synthethases HWANG KWANG YEON Korea University Korea 超分子構造解析学研究室

超高磁場NMR共同利用研究課題

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No 実験課題 実験責任者 実験責任者所属
1 Ferredoxin-NADP+酸化還元酵素の酵素基質間相互作用のNMR解析 瀬尾 悌介 金沢大学 理工研究域物質化学系
2 CD28ファミリー分子細胞内領域とPI3KSH2ドメインとの分子間相互作用解析 織田 昌幸 京都府立大学 大学院生命環境科学研究科
3 マラリア原虫アピコプラストへの蛋白質輸送におけるNMRスペクトル解析 齊藤 貴士 北海道薬科大学 薬学部
4 NMRを用いた蛋白質分子中のねじれ型アミド構造の検出 神田 大輔 九州大学 生体防御医学研究所
5 ミトコンドリア呼吸鎖におけるシトクロム c-シトクロム酸化酵素間の電子伝達機構の構造化学的解析 石森 浩一郎 北海道大学 大学院理学研究院
6 タンパク質の翻訳後修飾と構造揺らぎ 北原 亮 立命館大学 薬学部
7 疾患関連蛋白質、機能性核酸及び木質バイオマスの構造・機能・分子運動相関解析 永田 崇 京都大学 エネルギー理工学研究所
8 NMRに基づく認知症原因タンパク質のオリゴマー化メカニズムの解析 寺沢 宏明 熊本大学 大学院生命科学研究部
9 ピロリ菌由来のニッケル結合蛋白質Hpnにおけるニッケル結合様式の解明 森田 勇人 城西大学 理学部
10 NMRによる細胞内タンパク質の構造解析 栃尾 豪人 京都大学 大学院理学研究科
11 脂質バイセルと溶液NMRを組み合わせた膜タンパク質-脂質膜相互作用解析 長尾 聡 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科
12 動的構造解析によるタンパク質線維化機構の解明 菅瀬 謙治 京都大学 大学院工学研究科
13 抗体のFc領域をモデル系とした高分子量の糖蛋白質の構造解析法の開拓 加藤 晃一 自然科学研究機構 岡崎統合バイオサイエンスセンター

クライオ電子顕微鏡共同利用研究課題

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No 実験課題 実験責任者 実験責任者所属
1 セルロース合成酵素複合体の会合体構造決定 今井 友也 京都大学 生存圏研究所
2 脂質輸送粒子リポホリンのクライオ電子顕微鏡での形状観察 前仲 勝実 北海道大学 大学院薬学研究院
3 アクチン‐フォルミン複合体の三次元構造解析 成田 哲博 名古屋大学 理学研究科構造生物学研究センター
4 微小管・ダイニン複合体の構造解析 包 明久 東京大学 大学院医学系研究科
5 ミトコンドリア外膜トランスロケーターTOM複合体の立体構造解析 荒磯 裕平 京都産業大学 総合生命科学部
6 イオン輸送体の単粒子構造解析 西澤 知宏 東京大学 大学院理学系研究科

客員フェロー

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No 実験課題 実験責任者 実験責任者所属
1 組み換え蛋白質を用いた難溶蛋白質凝集体可溶化の方法開発 櫻井 一正 近畿大学先端技術総合研究所
2 光照射固体NMRによる光受容膜タンパク質の光励起中間体形生成機構の解明 内藤 晶 横浜国立大学大学院工学研究院