Examples and Protocols - 実験例とプロトコール

Laboratory for Biomolecular Analysis, Institute for Protein Research, Osaka Univ.

2023.9.29 更新　

• N-terminal sequencing of protiens on Shimadzu PPSQ 53A gradient system
  タンパク質のN末端アミノ酸配列解析
Apomyoglobin, MW=17K, Seq=GLSDGEWQQV...

5pmol, dot blot
2pmol, dot blot

BSA, MW=66K, Seq=DTHKSEIAHR...

5 pmol, dot blot

Standard PTH-amino acids



• Sample preparation for protein sequencing
  シーケンス用サンプルの調整法
• Staining PVDF membrane with CBB R-250 for protein sequencing
  PVDF膜に転写したサンプルのCBB染色
• Reduction and alkylation of protein cysteine residues on PVDF membrane
  PVDF膜上でのシステインの還元アルキル化
• Digestion of protein on PVDF membrane
  PVDF膜上でのタンパク質の酵素消化
• Reduction, alkylation and digestion of protein in solution
  溶液タンパク質の還元アルキル化と酵素消化

• Measurement of protein mass (linear mode)
  タンパク質の測定（リニアーモード）
• Measurement of peptide mass (reflector mode)
  ペプチドの測定（リフレクターモード）
• Peptide mass fingerprinting and protein identification
  ペプチドマスフィンガープリンティングと、タンパク質の同定（リフレクターモード）
• N-terminal sequencing by MALDI-TOF MS (in-source decay)
  MALDI-TOF MSによるN末端のアミノ酸配列解析